Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC112Q8NEF3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms