Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BARD1-201ENST00000260947 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms