Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NIPSNAP2O75323 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms