Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
V9GYQ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
V9GYQ6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
V9GYQ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
V9GYQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
V9GYQ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
V9GYQ6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
V9GYQ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms