Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIAS3Q9Y6X2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIAS3Q9Y6X2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIAS3Q9Y6X2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms