Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC1Q9Y5R8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC1Q9Y5R8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms