Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHLDA3Q9Y5J5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms