Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y534

CSDC2, Cold shock domain-containing protein C2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDC2Q9Y534 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CSDC2Q9Y534 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSDC2Q9Y534 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms