Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAB1Q9Y478 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKAB1Q9Y478 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms