Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMED3Q9Y3Q3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMED3Q9Y3Q3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms