Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRG3Q9Y2Y8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRG3Q9Y2Y8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms