Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC27A6Q9Y2P4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC27A6Q9Y2P4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms