Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIKFYVEQ9Y2I7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PIKFYVEQ9Y2I7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PIKFYVEQ9Y2I7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms