Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EFR3BQ9Y2G0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms