Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN3Q9UPQ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN3Q9UPQ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms