Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAF8Q9UPN6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SCAF8Q9UPN6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAF8Q9UPN6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms