Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKW4

VAV3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, humanhuman

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV3Q9UKW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAV3Q9UKW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
VAV3Q9UKW4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VAV3Q9UKW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms