Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AMFRQ9UKV5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AMFRQ9UKV5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms