Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACSIN3Q9UKS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACSIN3Q9UKS6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms