Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHIC2Q9UKJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CHIC2Q9UKJ5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC2Q9UKJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHIC2Q9UKJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms