Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MSRAQ9UJ68 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MSRAQ9UJ68 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MSRAQ9UJ68 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms