Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASIC3Q9UHC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms