Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3BQ9UH17 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOBEC3BQ9UH17 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms