Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLIP2Q9UDT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms