Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CACNG4Q9UBN1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG4Q9UBN1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG4Q9UBN1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms