Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHD7Q9P2D1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHD7Q9P2D1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms