Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTN3Q9P232 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN3Q9P232 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms