Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAMSAP3Q9P1Y5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMSAP3Q9P1Y5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAMSAP3Q9P1Y5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAMSAP3Q9P1Y5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAMSAP3Q9P1Y5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms