Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNRD1Q9P1U0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNRD1Q9P1U0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms