Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ITSN2Q9NZM3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITSN2Q9NZM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN2Q9NZM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms