Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ08

ERAP1, Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERAP1Q9NZ08 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERAP1Q9NZ08 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERAP1Q9NZ08 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ERAP1Q9NZ08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms