Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC10Q9NYD6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXC10Q9NYD6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXC10Q9NYD6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms