Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NDE1Q9NXR1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDE1Q9NXR1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms