Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CWC25Q9NXE8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC25Q9NXE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC25Q9NXE8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms