Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HCFC1R1Q9NWW0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCFC1R1Q9NWW0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HCFC1R1Q9NWW0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms