Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXD4L1Q9NU39 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXD4L1Q9NU39 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms