Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EMILIN3Q9NT22 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms