Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SAMSN1Q9NSI8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SAMSN1Q9NSI8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms