Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FARSBQ9NSD9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FARSBQ9NSD9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms