Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PFDN4Q9NQP4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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