Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VTA1Q9NP79 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VTA1Q9NP79 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms