Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVK-5Q9HDB9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVK-5Q9HDB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms