Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCCC2Q9HCC0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MCCC2Q9HCC0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms