Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPCSQ9HAB8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPCSQ9HAB8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms