Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5N1

RABEP2, Rab GTPase-binding effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP2Q9H5N1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RABEP2Q9H5N1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABEP2Q9H5N1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABEP2Q9H5N1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms