Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPRTNQ9H040 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPRTNQ9H040 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms