Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC90BQ9GZT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC90BQ9GZT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms