Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA4CQ9C0C4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms