Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM5Q9C035 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM5Q9C035 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms