Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDCA4Q9BXL8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDCA4Q9BXL8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms